崇禎十七年（1644年）三月十九，李自成大軍勢如破竹攻入北京城。這天夜里，崇禎與太監王承恩行至南宮，登上煤山，只見遠處烽火連天，他不禁感嘆道：「苦了我的百姓了！」，隨后又返回了乾清宮。

他給內閣寫了手諭，讓成國公朱純臣輔佐東宮太子，提督內外軍務。然后又召周皇后、袁貴妃，以及太子、永王和定王入宮。

崇禎原本有七個兒子，長子朱慈烺被立為太子，次子朱慈煥早夭，三子朱慈炯被封為定王，這三個兒子都是周皇后所生。四子朱慈炤被封為永王，為田貴妃所生，還有五、六、七子都夭折了。

三子被召入宮中后，崇禎見他們身上還穿著華美的綢緞錦衣，說這都什麼時候了還穿這些衣服，這會招來殺頭的危險。于是，他忙命左右尋來破衣讓三個兒子換上。

那時太子十五六歲，定王和永王也就是十二三歲，他們似乎還沒有意識到此時的境遇有多危險。崇禎希望給自己留下點血脈，他打算把他們送到各自的外公家中，并囑咐他們此后要隱姓埋名，萬一保全了性命，要記得給父母報仇雪恨。

送走了三個兒子之后，崇禎對周皇后說，大勢已去，你作為皇后國母，也應當自盡。周皇后聽后，痛苦失聲地說，臣妾侍奉陛下十八年了，早就勸你南遷你不聽，否則何以到了今日這步田地！大概這就是命吧，能為大明社稷殉身，也沒有什麼遺憾了。之后，她回到坤寧宮，自盡身亡。

崇禎又賜了白綾給袁貴妃以及西宮眾嬪妃，對她們說，皇宮馬上就要被攻破了，你們要守住貞節，以保全祖宗的禮制，一定不能落到闖賊手里，之后讓她們回去自盡。

接著崇禎還想到了公主，他心想也不能讓闖賊玷污了公主。于是狠一心，提劍直奔寧壽宮，就是長平公主住的地方。

公主看到滿臉殺氣的父親闖了進來，便心知不妙，于是哭著懇求崇禎。崇禎不忍，拔劍用袖子遮住臉，一邊說，你何苦要生在我家；一邊一劍砍向公主。公主舉胳膊來擋，結果被砍了右臂，昏倒在地。之后崇禎又殺了幼女昭仁公主及幾個嬪妃。

在這一天，崇禎逼迫皇后和嬪妃自盡，殺死了自己的女兒，放走了自己的兒子。最后走投無路的崇禎，與他的親信太監王承恩來到故宮北面的景山（也叫煤山、萬歲山）自縊而亡，年僅三十五歲，明朝亡。

北京城新的主人李自成騎馬直入承天門，他指著承天門的匾額說，如果他能射中「天」字，必定能一統天下，結果偏偏沒射中，一箭射在了天字的下面，李自成不禁愕然。

偽丞相牛金星見狀，忙說，射中天字之下，應當中分天下。李自成才高興起來，登上了皇極殿，隨后問左右索要大明皇帝、皇后。

到了第二天，才有人來報，說崇禎已自盡了。李自成命人將尸首抬到東華門，只見死去的崇禎披頭散發，左腳光著，只右腳穿了一只靴 ，身穿藍袍，衣襟中還有一封遺詔：

朕涼德藐躬，上干天咎，致逆賊直逼京師，此皆諸臣誤朕。朕死無面目見祖宗于地下，自去冠冕，以發覆面。任賊分裂朕尸，勿傷百姓一人！

之后李自成又向后宮索要皇后，手下又將周皇后的尸體也拖到了他的面前。李自成看到皇后已死，于是下令將崇禎、周皇后一起送往昌平埋葬，昌平的百姓將皇帝、周皇后和田貴妃合葬到了一起。

崇禎怎麼也不會想到，他精心為寵妃田貴妃精心建造的陵墓，最后也成為了自己的歸宿。

田貴妃墓的地宮規模很大，分為前后兩層，第一層是享殿，有三間。殿內設有各種祭器，各類裝飾一應俱全。第二層是安放棺槨的大殿，共九間，崇禎、周皇后、田貴妃三人的棺槨都存放于此。

田妃墓當時并沒有建地上享殿，清廷為籠絡人心，入關后下令以帝后之禮重新為崇禎帝后安葬，并改田姐墓為思陵，還為其建造了園寢建筑，將田姐墓升級為帝陵，成為明十三陵的最后一陵。

紫禁城淪陷的時候，宮中早已亂作一團。關于此時的皇宮也流傳了諸多故事，但并不具備官方意義，以下大家可以參考。

據說暈倒在地的長公主，後來被好心的太監何新和一名姓費的宮女所救，後來被偷偷送出了宮。關于長平公主的結局也有諸多說法，有說她被送到了周皇后的父親周奎府上；也有說被叛軍所俘，以失去一條手臂的代價存活了下來。

等到清軍入關后，她被當成了清廷籠絡人心的籌碼，受到了「優待」，將她安置在其外祖父周奎府上，并讓周家好好伺候她。

長平公主失去了國，也失去了家，唯一讓她期待的就是她的三個兄弟，希望他們能夠復國。但遺憾的是順治二年，她聽說太子已死，于是向多爾袞請求出家。

多爾袞怎麼可能讓這枚棋子浪費掉，駁回她的請求，按照崇禎在位時的婚約，將她風光地嫁給了周世顯。但婚后的長平公主并不幸福，不久便死去，有人說死于難產，也有說是積郁成疾。

話說救助長平公主的那名姓費的宮女，故事也頗具傳奇色彩。為了救公主，她與公主互換衣服，之后藏到了枯井里。農民軍入宮后，到處尋找宮娥，很快就發現了枯井里的費宮女，于是便將她從井中鉤了出來。

費宮人年方二八，容貌出眾，在李自成面前，她自稱是長平公主，但太監們都說她不是，于是李自成就把她賜給了他的愛將，一名叫羅虎，也有說是王虎，沒有明確史料可考。

羅虎見她美艷動人，就帶出宮舉辦婚禮。大婚之日，羅虎喝得酩酊大醉，夜半時分，費宮女命侍女出去，然后走到羅虎的睡榻前，從懷中取出匕首，用盡生平力氣刺入羅虎的喉嚨，羅虎三次躍起三次倒下，最后氣絕身亡。

費宮女見羅虎已死，她自言自語道：我一個弱女子，能殺死一名賊帥，也不枉此生。說完也自盡了。關于費宮女的故事後來寫成了劇本，一直在民間流傳。

還有一名魏姓宮女，她看著賊兵涌入，最后選擇跳進了御河，跟著魏氏一起尋死的宮女有一二百名。

另外還有說，當時的袁貴妃也被太監救走了。可見，紫禁城失陷后，不論皇后還是嬪妃，死得死，傷得傷，逃得逃，那些宮女就更不必說了，命如草芥，任由李自成軍蹂躪，或死或傷逃，都成了明帝國的犧牲品。

崇禎不是將三個兒子都送出宮了嗎？但三個兒子最終還是到了李自成的手里。太子去到外祖父周奎家時，周奎家閉門不讓他入，太監便把他送給了李自成，之后被李自成封為宋王，最后是死是活，也成了迷。

定王朱慈炯被李自成俘虜后，封為定安公。李自成敗退京城后，定王也是下落不明，不過關于「朱三太子」的故事卻一直流傳在民間，而「朱三太子」的原型就是朱慈炯。

永王朱慈炤是田貴妃的兒子，也與兩位哥哥一起被俘，封為宅安公。李自成退出北京后，也不知去向，但傳說卻有不少。有人說他被周奎家的仆人周思美帶走，改名周琰，逃到了湖北。後來在清朝康熙年間，隨湖廣填四川的人到了西充農村落戶，為逃避清廷追捕，又改名胡琰。之后娶了趙氏為妻，在西充經商致富，子孫興旺發達。

胡氏夫婦死后，其后裔泄露了家庭隱私，于是當地人稱他們的墓地為「皇家之墓」。這只是眾多故事中的一個版本，僅供參考。

李自成占據京城后，一直住在皇宮里，成國公朱純臣、大學士魏藻德、陳演等人居然帶領百官前去祝賀，勸他登基。不過此時的李自成還顧不上登基，他忙著搜刮錢財安撫手下。

他把這些明朝大臣抓起來，交給劉宗敏處理，劉通過嚴刑拷打的手段逼迫他們獻銀。農民軍從皇親周奎家抄出現銀五十二萬兩，和價值幾十萬兩的珍寶；從太監王之心家抄出現銀十五萬兩，也有無數珍寶。

吳三桂的父親吳襄也是其中之一，家產被全沒收，家人也被李自成抓了起來，其中就有吳三桂的愛妾陳圓圓。李自成通過這種手段，讓明臣貢獻了不少銀子，呆在皇宮過了一段荒淫無度的生活。

不過可悲的是，皇帝椅子還沒坐熱，吳三桂就聯合清軍來找他算賬了，最后不得不退出北京城。

關于李自成占領紫禁城皇宮后的故事，有史料也有杜撰。崇禎朱由檢一生勤政，好讀經、史之書，在明代諸帝中是少有的。在位十七年，幾乎沒有一天安穩日子，最后還是成為亡國之君，殺死后妃，砍傷子女，散發上吊，實在是悲慘至極，但是否值得同情，則是另有說法。